将尼安德特人的DNA从现代人类污染中分离出来
2021-11-30 15:08:05
lee
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古代DNA分子的检索通常采取特殊的预防奥立龙ORION措施，以防止研究人员或环境中的DNA与化石中的DNA混合。然而，许多古代化石几十年来一直被博物馆收藏，并且在进入DNA实验室之前被当今的人类DNA污染。
本周在PNAS期刊的在线版上提出的一种新方法为这个问题提供了解决方案。一个关于如何在DNA序列中检测降解的统计模型被证明能够从古代骨骼中分离出DNA，即使它的数量远远超过现代DNA污染 - 不是在实验室中，而是在计算机中。
"许多来自古代人类的非常有趣的DNA数据集由于污染而从未见过光明。这种方法背后的想法是改变这种状况，"该研究的主要作者，乌普萨拉大学进化遗传学博士Pontus Skoglund说。
为了将这种方法应用于现实世界的化石，Pontus Skoglund和他的导师，乌普萨拉大学进化生物学系教授，该研究的资深作者，与德国莱比锡马克斯普朗克进化人类学研究所的Johannes Krause和Svante Pääbo合作，他们有一个测序的线粒体DNA来自西伯利亚阿尔泰山脉Okladnikov洞穴的尼安德特骨头。 但发现骨头里也有现代人的DNA。新方法的应用使现代人类DNA得以被去除，而Okladnikov个体的完整线粒体基因组表明，它与欧洲其他尼安德特人密切相关。
目前的缺点是DNA必须至少有一千年的历史才能与现代DNA分离，因此对近代历史人物的研究仍然面临许多挑战。
"有许多非常有趣的古代人类遗骸，我们可以用这种方法从严重的污染中拯救出来。这种方法不仅限于尼安德特人，即使是被现代人类污染的解剖学现代人类的遗骸也可以被拯救出来，"Mattias Jakobsson说。